OAU perusti 1987 toimikunnan (African Commission of Human and People’s Rights) edistämään ihmisoikeuksia ja turvaamaan niiden suojelua Afrikassa. Toimikunnassa on 11 jäsentä. Heidät on valittu henkilökohtaisten kykyjen ja rehellisyyden pohjalta. He toimivat jäseninä henkilökohtaiselta pohjalta eivätkä siis ole hallitusten edustajia. Toimikunnalla on lukuisia tehtäviä, mukaan lukien peruskirjassa esitettyjen oikeuksien suojelu sekä niistä käytävän keskustelun ja niiden kehittämisen edistäminen.

Toimikunta tutkii sopimusvaltioiden toimittamat määräaikaisraportit ja keskustelee niistä hallitusten edustajien kanssa rohkaistakseen valtioita toteuttamaan ihmisoikeusvelvoitteensa. Toimikunta nimitti 1994 erityisraportoijan tutkimaan laittomia teloituksia. Hänen ensimmäisinä vastuualueinaan olivat Ruandan tilanne ja Afrikan lasten laittomat teloitukset.  

Peruskirja on sikäli ainutlaatuinen, että kaikkien sopimusvaltioiden on hyväksyttävä toimikunnan oikeus vastaanottaa valituksia peruskirjan takaamien ihmisoikeuksien loukkauksista. Valituksia voivat tehdä sopimusvaltioiden lisäksi yksittäiset ihmiset ja kansalaisjärjestöt sillä ehdolla, että väitetty loukkaaja on ratifioinut peruskirjan. Menettely on luottamuksellinen, mutta toimikunta julkaisee vuosiraportissaan tiivistelmän käsitellyistä tapauksista. Toimikunta valmistelee raportin tapauksen tosiasioista, havainnoistaan ja suosituksistaan. Se toimitetaan kyseessä olevalle valtiolle sekä OAU:n yleiskokoukselle, joka voi päättää havaintojen julkistamisesta. 

Edistääkseen peruskirjan sisältämien oikeuksien toteutumista toimikunta on laatinut työryhmiä ja keskustelutilaisuuksia käsittävän ohjelman, jota toteutetaan pitkälti yhteistyössä kansalaisjärjestöjen kanssa. Toimikunta on myös perustanut Sambian Banjuliin dokumentaatiokeskuksen, ja se julkaisee African Review of Human Rights -aikakauslehteä. Toimikunta antaa myös selittäviä lausuntoja peruskirjan erityismääräyksistä. Niiden tarkoituksena on ratkaista ihmisoikeuksiin ja kansojen oikeuksiin liittyviä oikeudellisia ongelmia. Afrikan hallitukset voivat perustaa oman lainsäädäntönsä lausuntojen pohjalle. Lausuntoja on annettu mm. oikeudesta oikeudenmukaiseen oikeudenkäyntiin ja humanitaarisen oikeuden kunnioittamisesta.

Perustuu tekstiin Levin: Ihmisoikeudet. Kysymyksiä ja vastauksia.